第二集中(zhōng )，尼奥(ào )（基(⛳)努(nǔ )·里维斯(sī ) Keanu Reeves 饰(shì )）没有(🥊)能从内部(💍)摧(cuī )(🚗)毁“母体(🈸)”，他的(de )身(shēn )体在真(🥋)实世界的飞船上陷(xiàn )于昏迷(mí )，思(sī )想(xiǎng )却被困在介(jiè )于(yú )“母(😙)体(🤥)”和(hé )真实(👌)世界的中间(👵)地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯(🔫)（劳伦斯(🌸)·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和(hé )崔妮(nī )蒂(😉)（凯瑞-安·(❄)莫斯 Carrie-Anne Moss 饰(😲)）等人(rén )知道了尼(ní )奥的(🛌)情(🍾)况，在守护天(tiān )使的(de )带领(🍉)下(🗒)， 找(🌒)到了“火车人(rén )(🐸)”的控制(zhì )者梅罗纹(♟)奇，经过(🍏)一番激(⏭)斗，将尼奥救(jiù )了(😙)出来。此时，电(diàn )子乌贼部队对(😞)锡安(❔)发起了猛烈的攻击(⤴)，人(rén )类组织所有机(jī )甲战士展开(🥖)顽强的抵抗(☕)，形势危在旦夕(🍀)；尼奥和崔(😄)妮蒂驾驶了一艘飞(fēi )(🎄)船克服(⏭)重重困难，到达(dá )机器(🍶)城市，尼奥(ào )(📊)终(zhōng )于(yú )见到了机器世界的统治者“机器(qì )大帝”，双(shuāng )方谈(🥤)判并(📐)达成了协议(🙈)：尼奥除掉不受“母体(tǐ )(🌚)”控制的史(shǐ )密斯，以换取锡安的和平(📌)。在“母体(tǐ )”中，尼奥和(hé )(🏆)史密斯展(📲)开(kāi )了(le )关(guān )系(♌)人类生死存亡的最后决(jué )斗(dòu )。